2006年
- 1月11日 盐田国际集装箱码头有限公司在花园格兰云天大酒店召开“《盐田港对地区经济贡献度专题研究报告》评审会”。
- 1月14日 原国务委员兼国家科委主任宋健第三次视察盐田港区。
- 1月15日 朝鲜劳动党总书记、国防委员会委员长金正日考察盐田港区。
- 1月17日 深圳市副市长、盐田港建设指挥部总指挥张思平和市国资委党委副书记柏立新到盐田港集团工作调研。
- 1月18日 盐田港集团2006年迎春晚会在东湖宾馆举行。“感动中国-2005年度人物”丛飞忍着病痛，以惊人的意志出席了晚会，将爱心传承。
- 2月8日 “深圳市盐田港房地产公司”更名为“深圳市盐田港置业有限公司”〔经营范围不变〕揭牌仪式在烟墩山举行。
- 3月8日 盐田港A〔000088〕股东会议以无记名投票方式审计通过《深圳市盐田港股份有限公司股权分置改革方案》，赞成票1，125，971，759股，占参加表决股份总数的98.88％；反对票12，618，868股，占参加表决股份总数的1.11％；弃权票150，522股，占参加表决股份总数的0.01％。
- 2月27日 美国海岸警卫队司令托马斯？柯林斯海军上将一行访问盐田国际。3月14日，美国海岸警卫队再次组团对盐田国际港口设施保安工作进行实地考察。
- 3月28日 深圳市市长许宗衡和市政府秘书长唐杰帶领有关部门领导到盐田港集团及码头扩建工程工地调研并现场办公。
- 3月31日 盐田港保税物流园区正式运作。货主期盼已久的进出口货物“一次申报、一次查验、一次放行”的海关通关措施即将在盐田港保税物流园区成为现实，其他口岸监管部门为园区企业提供的多种便利服务亦配套推出，令该园区成为深圳乃至华南地区目前货物通关最为便捷的通道之一。
- 4月13日 香港工业贸易署署长杨立门一行16人参观盐田港。
- 4月19日 盐田港保税物流园区在香港举办投资推介洽谈会。会上，UPS、伯灵顿、综合信兴、香港新兴机构等7家企业与盐田港保税物流园区签约。
- 4月21日 原东鹏实业有限公司总经理吴显基因病逝世，终年60岁。吴显基先生为盐田港的早期建设呕心沥血，艰苦创业，做出了卓越的贡献。
- 5月9日 盐田港集团捐资450万元帮扶贵州省荔波县新建第二中学主教学楼签字仪式在荔波县举行。
- 5月10日 由深圳市政府投资建设的第一条疏港专用通道--盐排高速正式建成通车。盐排高速南起盐田港，北至机荷高速的排榜立交并与规划中的博深高速（博罗－深圳）相接，是盐田港连接机荷高速和外环高速的重要通道。
- 5月16日 江西省省委书记孟建柱、省长黄智权率党政代表团一行120人考察盐田港区。
- 5月18日 今年第一号强台风“珍珠”过后，港区恢复运营的第一天，集装箱拖车拥塞造成盐田区内主支干线交通大堵塞。
- 5月23日 盐田区盐田三村、四村和西山吓村整体搬迁现场指挥部成立。它意味着2005年2月24日市人民政府三届146次会议审议并原则通过的盐田三村、四村和西山吓村整体搬迁方案进入实施阶段，将为盐田港区增加27万平方米土地资源。
- 5月25日 经海关批准，盐田港中西港区实现一体化操作，港区代码统一方案于即日起正式实施。
- 5月26日 盐田港集团举行总部机构改革动员大会。此次机构改革，遵循公开、公平、公正的原则，委托深圳市高级人才测评中心制作方案和负责考评，采取总部内部员工全员竞争上岗，分步实施的办法进行。
- 6月1日 自即日起，海关转关施封业务由闸口施封更改至查验中心施封，此举将最终实现货物24小时通关，促进进口转关业务发展。
- 6月23日 台湾高雄客家文化交流团170人参观盐田港。
- 7月26日 盐田港集团领导班子成员和部分中层管理人员现场考察了大铲湾装集箱码头一、二期工程。盐田港集团作为大铲湾港的股东，此次工作性考察就该码头的规划、建设和经营进行了交流和沟通。
- 8月10日 盐田港区三期集装箱码头扩建工程12＃、13＃泊位通过工程和口岸查验监管设施验收。新泊位总长668.8米，泊位与航道水深均为16米，可操作12,000标准箱的超大型集装箱船舶，配备了目前市场上装卸效率最高的40英尺双箱并排岸吊。
- 8月16日 盐田港区三期集装箱码头工程国家验收会议在五洲宾馆举行。
- 8月23日 盐田港集团经济工作会议在东莞塘厦三正半山酒店举行。
- 8月份，盐田国际集装箱码头岸吊平均操作效率和街车流转时间分别达到35.18吊次/小时和35.68分钟，单月吞吐量继7月份再次突破70万标准箱。
- 9月2日 随着“长荣.荣德”号顺利挂靠12＃泊位，世界上最先进的一吊双箱岸吊抓起2个40英尺的集装箱，三扩工程的第一个集装箱深水码头投产。至此，盐田港区集装箱深水泊位已增加到11个。
- 9月6日 盐田港区发展战略与对策座谈会在香港召开。
- 9月13日 盐田港集团发展战略规划专家论证评审会在麒麟山庄召开。
- 10月9日 深圳市国资委对盐田港集团2001年7月投资“巨田证券”〔原：特区证券公司〕决策失误造成1.329亿元人民币经济损失予以通报批评（［2006］417号文件）。
- 10月12日 中国港口协会集装箱分会公布2006年度评优结果，盐田国际集装箱码头有限公司同时囊括“中国港口前十强集装箱码头”第一名、“中国港口杰出集装箱桥吊作业效率码头”第一名、“中国港口杰出集装箱船舶装卸效率码头”第一名，荣膺“2005年综合指标最佳集装箱码头”称号。
- 10月12日 中国国民党台南市党部主委吴朝昱一行36人，在中共深圳市委常委、统战部部长王毅、市外事办主任林洁的陪同下参观了盐田港。
- 10月14日 盐田港区12＃、13＃泊位迎来全球最大的货柜船“艾玛？马士基”轮。该轮总长397.71米，可载箱量11,000标准箱，总重量17万多吨，今年8月底才建成下水。10月5日，“艾玛？马士基”轮试航曾停泊盐田港。
- 10月16日 深圳市国有企业“三项制度改革”进入攻坚阶段。深圳市副市长、盐田港建设指挥部总指挥张思平亲临盐田港集团听取汇报。
- 10月17日 盐田港集邮协会举办纪念红军长征胜利70周年集邮收藏展。
- 10月20日 第十届全国政协副主席李贵鲜第五次视察盐田港区。
- 10月22日 香港民建联及立法会议员一行30人参观盐田港。
- 11月3日 中国交通运输协会会长、原交通部长钱永昌第三次考察盐田港。1987年，时任国家交通部部长的钱永昌曾为考察盐田港港址和参加奠基仪式两度到盐田。
- 11月8日 盐田三期国际集装箱码头有限公司68亿港元银行贷款签约仪式在五洲宾馆举行。深圳市市长许宗衡和副市长张思平、陈应春参加了仪式。
- 11月22日 经市国资委批准，国有独资的“深圳市盐田港物流有限公司”成立。撤销物流部，物流部资产、业务、人员全部并入深圳市盐田港物流有限公司；深圳市盐田港保税区投资开发有限公司经营性职能全部并入深圳市盐田港物流有限公司，继续承担工程代建管理任务。
- 11月22日 经市国资委批准，国有独资的“深圳市盐田东港区码头有限公司”成立。主要负责东港区项目的前期工作、项目建设以及经营和管理东港区码头泊位、仓储、配套设施及相关业务。
- 11月27日 盐田港商务配套服务区建设项目环境影响专家评审会在红桂一街环保大院召开。
- 11月28日 盐田东港区总平面布置方案专家研讨会在格兰云天大酒店召开。
- 12月5日 盐田港集团根据深国资委〔2006〕358、359号文件要求和“三项制度改革”工作布暑，召开“签订劳动合同补充协议”大会，九位中层管理人员代表签订了劳动合同补充协议。这标志着盐田港集团的“国有企业员工身份”的划断，由“企业人”到“社会人”的转变。市国资委副主任高雷亲临大会。
- 12月5日 深圳市副市长、盐田港建设指挥部总指挥张思平和市国资委主任郭立民到盐田港集团进行工作调研。
- 12月6日 第十届全国人大副委员长热地再次视察盐田港区。
- 12月14日 盐田港区迎来与全球最大的货柜船“艾玛？马士基”轮同级别的姐妹船--“埃斯特尔？马士基”轮。该轮总长397米，可载箱量11,000标准箱。盐田港天然的深水条件，先进的码头设施和突出的操作能力，是获得全球巨无霸集装箱船青睐的主要原因，是这类超大型船舶在中国大陆挂靠的唯一港口。
- 12月21日 “科学发展看广东—全国重点网络媒体广东行”采访团一行60人参观盐田港区。
- 12月26日 中国工程院院士考察团一行11人参观盐田港区。
- 12月26日 深圳市盐田港物流有限公司正式挂牌。
- 盐田港区2006年集装箱吞吐量886.46万标准箱。
- 盐田港集团有限公司总资产达到139.04亿元人民币，国有净资产87.58亿元人民币〔快报数〕。
